FETÖ'nün darbe girişimi sonrasında 16 Temmuz'da görevden uzaklaştırılan Çetinkaya, Ankara'nın Sincan ilçesinde kaldığı babasının evinde Organize Suçlarla Mücadele Şube Müdürlüğü ekiplerince gözaltına alındı.
Çetinkaya'nın eşi, Sinop Garnizon Komutan Vekili Albay Temel Çetinkaya ise yürütülen soruşturma kapsamında "FETÖ üyesi olmak" iddiasıyla gözaltına alınmış, sevk edildiği mahkemece tutuklanmıştı.